SPS協(xié)議強(qiáng)調(diào)，檢疫的保護(hù)水平應(yīng)是恰當(dāng)?shù)模⑼ㄟ^(guò)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估來(lái)確定。要求各締約方所采取的檢疫措施應(yīng)建立在風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估基礎(chǔ)上，應(yīng)考慮到對(duì)動(dòng)植物生命或健康的風(fēng)險(xiǎn)性，對(duì)環(huán)境的針對(duì)性，也可參考有關(guān)國(guó)際組織新開(kāi)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估技術(shù)。
　　在風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估中，要獲得生物學(xué)方面的科學(xué)依據(jù)，如：某些病蟲(chóng)害流行，病蟲(chóng)害非疫區(qū)的存在，有關(guān)的生態(tài)和環(huán)境條件；還包括有關(guān)檢驗(yàn)、抽樣和測(cè)試方法，以及檢疫或其他處理方法。
　　在風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估中，可考慮的經(jīng)濟(jì)因素：由于病蟲(chóng)害的傳入、定居或傳播，對(duì)生產(chǎn)或銷(xiāo)售造成損失的潛在損害；在進(jìn)口成員國(guó)領(lǐng)土上控制或根除病蟲(chóng)害的成本；以及采用其他方法來(lái)控制風(fēng)險(xiǎn)的有關(guān)實(shí)際開(kāi)支。
　　SPS措施強(qiáng)調(diào)，如一成員的檢疫措施的科學(xué)依據(jù)不足，這些檢疫措施只能是暫時(shí)的，應(yīng)收集更準(zhǔn)確的資料作PRA。