蘭州海關(guān)于1989年9月28日經(jīng)國務(wù)院批準正式成立，是直屬海關(guān)總署領(lǐng)導(dǎo)的正廳級海關(guān)。建關(guān)之初的監(jiān)管區(qū)域包括甘肅省、青海省、寧夏回族自治區(qū)“二省一區(qū)”。隨著銀川海關(guān)于1997年11月成立，西寧海關(guān)于1998年10月成立，蘭州海關(guān)的監(jiān)管區(qū)域變?yōu)楦拭C一省?，F(xiàn)行機構(gòu)設(shè)置有辦公室、審單技術(shù)處、綜合業(yè)務(wù)處、稽查處、人事教育處、財務(wù)裝備處、監(jiān)察審計室、現(xiàn)場業(yè)務(wù)處、機關(guān)服務(wù)中心等9個處級機構(gòu)和緝私局1個副廳（局）級機構(gòu)。蘭州海關(guān)地址：蘭州市安寧區(qū)銀安路9號，郵編：730070，總機：0931-7705000。 　2003年3月18日設(shè)立外派機構(gòu)——蘭州海關(guān)駐天水監(jiān)管組（正科級），隸屬現(xiàn)場業(yè)務(wù)處，授權(quán)辦理天水市、平?jīng)鍪?、慶陽市和隴南市的部分海關(guān)業(yè)務(wù)。蘭州海關(guān)駐天水監(jiān)管組辦公地點位于天水市建設(shè)路8號，郵編：741000，電話：0938—6812328。

　2004年5月25日，經(jīng)國務(wù)院批準設(shè)立酒泉海關(guān)（正處級隸屬關(guān)）。2007年10月26日，酒泉海關(guān)揭牌開關(guān)，負責辦理酒泉、嘉峪關(guān)、張掖三市企事業(yè)單位進出口海關(guān)通關(guān)業(yè)務(wù)。酒泉海關(guān)辦公地點位于酒泉市新城區(qū)富康路33號，郵編700730，總機電話：0937-2672345。

　建關(guān)以來，在海關(guān)總署的直接領(lǐng)導(dǎo)下，蘭州海關(guān)依靠甘肅省委、省政府的大力支持，正確行使國家賦予的權(quán)力，認真履行“把關(guān)服務(wù)”職能，依據(jù)《中華人民共和國海關(guān)法》及其他法律、法規(guī)，認真辦理進出口企業(yè)管理、減免稅審批、加工貿(mào)易合同備案、轉(zhuǎn)關(guān)運輸監(jiān)管等業(yè)務(wù)；對甘肅省國有大中型企業(yè)、外貿(mào)專業(yè)公司、工貿(mào)公司、三資企業(yè)進出境運輸工具、貨物、物品進行監(jiān)管，嚴格稅收征管，確保稅款及時入庫；大力開展查緝走私；積極發(fā)揮海關(guān)統(tǒng)計的預(yù)警、服務(wù)職能；配合國家西部大開發(fā)的實施，深化通關(guān)作業(yè)改革，大力推進和實施以風險管理為核心的現(xiàn)代海關(guān)制度第二步發(fā)展戰(zhàn)略，整頓和規(guī)范進出口貿(mào)易秩序，各項業(yè)務(wù)有了長足的發(fā)展，為促進甘肅省經(jīng)濟社會發(fā)展做出了應(yīng)有的貢獻。同時，蘭州海關(guān)認真落實科學(xué)治關(guān)理念，以準軍事化海關(guān)紀律部隊建設(shè)為統(tǒng)領(lǐng)，大力加強干部隊伍建設(shè)和廉政建設(shè)，正確處理改革發(fā)展與穩(wěn)定的關(guān)系，較好地完成了各項工作任務(wù)，全關(guān)各項工作逐步走向正規(guī)化，保持了積極向上的發(fā)展勢頭，蘭州海關(guān)連續(xù)多年被評為省級精神文明行業(yè)和精神文明單位。